คลองเจดีย์บูชาเป็น มรดกทางประวัติศาสตร์และวัฒนธรรมของนครปฐม การพัฒนาจึงต้องมุ่งแก้ไขปัญหาที่ต้นทาง ฟื้นฟูระบบนิเวศ และสร้างคุณค่าจากการใช้ประโยชน์อย่างสมดุลและยั่งยืน โดยเสนอแนวทางสำคัญ ด้าน ได้แก่

• ลดมลพิษที่ต้นทางและยกระดับระบบบำบัดน้ำเสีย

• ใช้คุณภาพน้ำเป็นตัวชี้วัดความสำเร็จของแผน

• ฟื้นฟูระบบนิเวศด้วย Nature-based Solutions เพิ่มพื้นที่สีเขียวและพื้นที่ชุ่มน้ำ

• บูรณาการการบริหารจัดการทั้งลุ่มน้ำด้วยข้อมูลและเทคโนโลยี

• พัฒนาเศรษฐกิจชุมชนควบคู่การอนุรักษ์

• ส่งเสริมการมีส่วนร่วมของทุกภาคส่วน

• ประยุกต์ใช้เทคโนโลยีดิจิทัลเพื่อการบริหารจัดการที่มีประสิทธิภาพ

• เตรียมความพร้อมรองรับการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ

เป้าหมาย คือการยกระดับคุณภาพน้ำ ฟื้นฟูระบบนิเวศ สร้างคุณภาพชีวิตที่ดี พัฒนาเศรษฐกิจชุมชน และผลักดันคลองเจดีย์บูชาให้เป็นแหล่งเรียนรู้และแหล่งท่องเที่ยวเชิงวัฒนธรรม ต้นแบบการพัฒนาลำน้ำเมืองของจังหวัดนครปฐมอย่างยั่งยืน