สำนักงานทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมจังหวัดพระนครศรีอยุธยา มีหน้าที่และอํานาจ ตามกฎกระทรวง แบ่งส่วนราชการสํานักงานปลัดกระทรวง กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม พ.ศ. 2560 ดังต่อไปนี้

(๑) ปฏิบัติหน้าที่ในฐานะผู้แทนกระทรวงในส่วนภูมิภาคในการอํานวยการ ดําเนินการกํากับดูแล ส่งเสริม สนับสนุน และประสานการปฏิบัติภารกิจด้านทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมในเขตพื้นที่จังหวัด

(๒) จัดทําแผนบริหารจัดการทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมในระดับจังหวัด แผนปฏิบัติการ เพื่อการจัดการคุณภาพสิ่งแวดล้อมในระดับจังหวัดและร่วมจัดทําแผนพัฒนาจังหวัด กลุ่มจังหวัด และ ท้องถิ่น รวมทั้งแผนงานอื่นที่เกี่ยวข้อง

(๓) กํากับ เฝ้าระวัง ติดตาม ตรวจสอบ ประเมินผล บูรณาการการแก้ไขปัญหา และ รายงานสถานการณ์ด้านทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมของจังหวัด หน้า ๘ เล่ม ๑๓๔ ตอนที่ ๑๓๐ ก ราชกิจจานุเบกษา ๒๕ ธันวาคม ๒๕๖๐

(๔) ดําเนินการตามกฎหมายว่าด้วยป่าไม้ กฎหมายว่าด้วยป่าสงวนแห่งชาติ กฎหมายว่าด้วยสวนป่า กฎหมายว่าด้วยเลื่อยโซ่ยนต์ กฎหมายว่าด้วยการสงวนและคุ้มครองสัตว์ป่า กฎหมายว่าด้วยการส่งเสริม และรักษาคุณภาพสิ่งแวดล้อม กฎหมายที่เกี่ยวข้องกับการกํากับดูแลการประกอบกิจการน้ําบาดาล และกิจการประปาสัมปทาน รวมทั้งกฎหมายอื่นที่ได้รับมอบหมาย

(5) ส่งเสริม สนับสนุน เผยแพร่ ให้คําปรึกษา พัฒนาองค์ความรู้ และสร้างการมีส่วนร่วม ของประชาชน เครือข่าย และองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นในการสงวน อนุรักษ์ และพื้นฟูทรัพยากรธรรมชาติ และสิ่งแวดล้อม

(๖) ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง หรือที่ได้รับ มอบหมาย